A SECRETARIA MUNICIPAL DE ADMINISTRAÇÃO E FIANÇAS é responsável pelo patrimônio humano e material da prefeitura de São João do Pacuí, além de gerenciar as compras, licitações e contratos, padronizando a aquisição de bens e serviços, bem como é responsável por exercer com eficácia e transparência a administração dos recursos públicos, por meio do lançamento, controle, cobrança e arrecadação de tributos e taxas municipais.
Administra a área financeira e contábil, no que se referem a pagamentos, registros e controle dos atos administrativos financeiros, gerados pelo município e terceiros. Para o cumprimento de sua missão, é preciso perseguir os seguintes valores: prática de justiça fiscal, satisfação dos cidadãos com os serviços prestados, além da valorização e capacitação da equipe, em seus aspectos gerencial, técnico e humano.